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<unk>をOOV(out of vocabulary)なる呼び方をするようだけど、sortlm.pyの作りとしてOOVをあんまり考えてないとかそういうノリなんだろうか。まあ確かに、1-gramの単語に無いものが2-gram, 3-gramに出てきてもらっても困るんすよ、ではあるんだろうけど。
とりあえず、実績がある（と思う）IRSTLMで作った言語モデルのデータを食わせても動かないんですけど、sortlm.pyはその辺どうお考えなんです？ということは言えそう。（こちらで生成したdata.arpaに非は無いってことを言いたい）
Pythonはよく分からないんだけど、まあhow-toなweb見ながらいじるしかないだろうなあ…